mbf_gtf

可能是周围最快的Ensembl-GTF解析器（在我的系统上，读取1GB的人类GTF大约需要10秒）。

用法：mbf_gtf.parse_ensembl_gtf("filename.gtf", []) -> DataFrame的字典

文件可能使用gzip压缩 - 在这种情况下，它必须以".gz"结尾。

第二个参数可以是一个要检索的'features'列表 - 获取子集可以大大提高性能。

请注意，这非常特定于Ensembl，它不处理任何其他GTF格式，并且它丢弃了在子元素上重复的属性 - 即，外显子只有gene_id，没有gene_name、gene_version、gene_...

结果坐标是Pythonic的 - 即，从0开始（即从GTF中的值中减去-1）。

这是mbf_*生物信息学库系列的一部分。