#count #k-mer #gc #vs #histogram #content #create

app kmer_gc

创建 GC 内容与 K-mer 计数的二维直方图

3 个版本

0.1.2 2019 年 7 月 11 日
0.1.1 2019 年 7 月 11 日
0.1.0 2019 年 7 月 11 日

#16#vs

MIT/Apache

4KB

kmer_gc

生成 GC 内容与 k-mer 计数的二维直方图

USAGE:
    kmer_gc [OPTIONS] <INPUT> -k <K>

FLAGS:
    -h, --help       Prints help information
    -V, --version    Prints version information

OPTIONS:
    -k <K>
    -n, --nbins <N>          Number of bins in k-mer dimension (memory use will be O(NK), where K is k-mer length)
                             [default: 1000]
    -s, --sep <SEPARATOR>    Separator for output [default:  ]

ARGS:
    <INPUT>    Input file (with k-mer in 1st column and counts in 2nd column)

依赖项

~1MB
~11K SLoC