fastobo-syntax

PEG语法和pest词法分析器，用于OBO平面文件格式1.4。

概述

此库是使用pest解析器生成器对OBO平面文件格式1.4语法的严格实现。它从fastobo中分离出来，以减少编译时间，因为从grammar.pest派生OboLexer需要一些时间。

词法分析器本身在fastobo::parser中重新导出，因此可能不需要直接依赖此crate。

严格性

该语法是1.4格式的严格实现，但有以下例外

• property_value子句可以有一个未用引号包围的值。这是为了支持一些使用obo2owl或owlapi生成其OBO对应物（不引号包围属性值）的本体文件owlcs/owlapi#833。
• ISO-8601日期时间只能从规范格式（带有可选时区的YYYY-MM-DDTHH:MM:SS）解析。
• creation_date子句中的日期可以是完整的ISO-8601日期时间（如格式1.4规范建议），或仅是ISO-8601日期，如格式1.4指南建议（尽管是非规范性的）。

另请参阅

• fastobo：OBO格式版本1.4的抽象语法树和数据结构。
• fastobo-py：对 fastobo 库的 Python 风格绑定。

反馈

发现了一个错误？有一个增强请求？如果您需要报告或询问，请前往项目的 GitHub 问题跟踪器。如果您正在填写错误报告，请尽量提供有关问题的尽可能多的信息，并尝试在简单且易于复现的情况下重现相同的错误。

关于

该项目由 Martin Larralde 在 BBOP 团队 的 劳伦斯伯克利国家实验室 的硕士实习期间开发，由 Chris Mungall 指导。请引用此项目为：

Larralde M. 开发 Python 和 Rust 库以改进本体生态系统 [版本 1；未同行评审]。 F1000Research 2019，8(ISCB Comm J)：1500 (海报) (https://doi.org/10.7490/f1000research.1117405.1)