一个快速解析扩展 xyz (extxyz) 格式化学文件的解析器。

扩展 XYZ 格式是简单 XYZ 格式的增强版本，允许在文件中存在额外的列来存储额外的原子属性（力、电荷、标签等），以及在注释行中指定的分子属性（能量、偶极矩等）。

用法

示例用法

use extxyz::{read_xyz_frames, RawAtoms, Info};

fn main() -> anyhow::Result<()> {
    // a large xyz/extxyz trajectory file
    let f = "nmd.xyz";
    // skip the first 100 frames, and read frames with a step size `10`
    let selection = (100..).step_by(10);
    let frames = read_xyz_frames(f, selection)?;
    for frame in frames {
        let atoms = RawAtoms::parse_from(&frame)?;
        // it will returen error if the comment is not in normal extxyz format
        let info: Info = atoms.comment.parse()?;
        // get molecule's properties
        let energy = info.get("energy").unwrap();
        // get atom's properties
        for atom in atoms.atoms {
            // parse extra data for each atom
            let atom_properties = info.parse_extra_columns(&atom.extra)?;
            // get `forces` component for each atom
            let forces = &atom_properties["forces"];
        }
    }

    Ok(())
}