bcl2fq-stats

Illumina测序数据通常使用Bcl2fastq进行解复用，但并不总是容易从解复用数据中获得读数表。bcl2fq-stats旨在快速概述给定索引上的读数分布，并从未确定的读数中识别潜在的索引不匹配。

使用方法

程序以bcl2fastq输出文件夹中的Stats.json作为输入

bcl2fq-stats --json-file data/Stats.json

安装

git clone https://github.com/wckdouglas/bcl2fq-stats.git
cd bcl2fq-stats
cargo install --path .

或使用docker

docker pull ghcr.io/wckdouglas/bcl2fq-stats:main