Row

Row 是一个命令行工具，可以帮助您管理 HPC 资源上的工作流程。在工作流程配置文件中定义 操作，这些操作适用于您的 工作空间 中 目录 的 组。将操作 提交 到您集群的 调度器。Row 跟踪已提交到哪些目录的操作，以确保您不会提交重复的工作。一旦作业完成，后续操作将变得合格，允许您通过多次提交将整个工作流程处理完毕。

名字叫 row，就像 "row, row, row your boat"。

显著特性

• 支持任意目录和 signac 工作空间。
• 在配置文件中定义您的 workflow。
• 通过用户定义的 shell 命令执行操作。
• 灵活的组定义
  • 根据它们的值选择目录。
  • 根据它们的值分割目录，或将其分割成固定大小的组。
  • 构建任何合格目录的组或要求整个匹配组作为整体提交。
• 顺序或并行执行组。
• 安排 CPU 和 GPU 资源。
• 多个用户可以操作相同的 workflow。
• 根据作业的资源和大自动确定分区。
• 为许多国家和大学的 HPC 系统内置配置。
• 为您的资源添加自定义集群定义。
• Row 是 快速 的。

演示

$ row submit --action=step1 -n 1
[1/1] Submitting action 'step1' on directory dir12 and 3 more (0ms).
Row submitted job 5095791.

$ row show status
Action     Completed Submitted Eligible Waiting Remaining cost
initialize        50         0       50       0    8 CPU-hours
step1              4         4       42      50   2K CPU-hours
step2              0         0        4      96  800 GPU-hours

$ row show directories --action step1 -n 3 --value="/value"
Directory Status    Job ID        /value
dir1      completed                  116
dir10     completed                  952
dir100    completed                  139
dir11     completed                  998

dir12     submitted anvil/5095791    950
dir13     submitted anvil/5095791    107
dir14     submitted anvil/5095791    127
dir15     submitted anvil/5095791    122

dir16     eligible                   682
dir17     eligible                   816
dir18     eligible                   803
dir19     eligible                   691

资源

• 文档：教程、命令行界面文档和配置文件规范。
• Row 讨论板：向 row 用户社区寻求帮助。
• signac：Python 包，用于帮助您管理工作空间。

历史

Row 是 signac-flow 的精神继承者。