致谢

这项工作主要基于 openslide-rust库 和 openslide-python库

openslide-rs

OpenSlide的Rust接口 (https://openslide.org/)。

此工作与官方OpenSlide项目无关联。

openslide-rs是OpenSlide库的Rust接口。

OpenSlide 是一个C库，提供了读取全切片图像（也称为虚拟切片）的简单接口，这些图像是数字病理学中使用的具有高分辨率的图像。这些图像在未压缩的情况下可能占用数十吉字节，因此不能使用标准工具或库轻松读取，这些工具或库是为可以舒适地解压缩到RAM中的图像设计的。全切片图像通常是多分辨率的；OpenSlide允许以最接近所需缩放级别的分辨率读取少量图像数据。

OpenSlide可以读取以下格式的虚拟切片

• Aperio (.svs, .tif)
• Hamamatsu (.ndpi, .vmu)
• Leica (.scn)
• MIRAX (.mrxs)
• Philips (.tiff)
• Sakura (.svslide)
• Trestle (.tif)
• Ventana (.bif, .tif)
• 通用瓦片TIFF (.tif)

要求

• Rust ≥ 1.56
• OpenSlide构建依赖（由于openslide-sys依赖项的必要而需要）

安装

OpenSlide-rs需要OpenSlide。

您将找到一个Makefile来帮助您安装Ubuntu和MacOs所需的所有依赖项。以下是要运行以构建此crate的命令

依赖项

要构建此crate，您需要安装OpenSlide

您还将找到一个Makefile来帮助您安装Ubuntu和MacOs所需的所有依赖项

MacOs

brew update
brew install openslide

Ubuntu

apt-get update
apt-get install -y --no-install-recommends libopenslide-dev

更多信息

• API文档
• 网站
• GitHub
• 示例数据