19个版本 (12个稳定版)
| 2.1.1 | 2024年7月18日 |
|---|---|
| 2.0.2 | 2024年4月11日 |
| 2.0.1 | 2024年1月24日 |
| 2.0.0 | 2023年12月9日 |
| 0.3.3 | 2022年10月25日 |
在 科学 中排名第40
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2MB
2K SLoC
致谢
这项工作主要基于 openslide-rust库 和 openslide-python库
openslide-rs
OpenSlide的Rust接口 (https://openslide.org/)。
此工作与官方OpenSlide项目无关联。
openslide-rs是OpenSlide库的Rust接口。
OpenSlide 是一个C库，提供了读取全切片图像（也称为虚拟切片）的简单接口，这些图像是数字病理学中使用的具有高分辨率的图像。这些图像在未压缩的情况下可能占用数十吉字节，因此不能使用标准工具或库轻松读取，这些工具或库是为可以舒适地解压缩到RAM中的图像设计的。全切片图像通常是多分辨率的；OpenSlide允许以最接近所需缩放级别的分辨率读取少量图像数据。
OpenSlide可以读取以下格式的虚拟切片
- Aperio (
.svs,.tif) - Hamamatsu (
.ndpi,.vmu) - Leica (
.scn) - MIRAX (
.mrxs) - Philips (
.tiff) - Sakura (
.svslide) - Trestle (
.tif) - Ventana (
.bif,.tif) - 通用瓦片TIFF (
.tif)
要求
- Rust ≥ 1.56
- OpenSlide构建依赖（由于openslide-sys依赖项的必要而需要）
安装
OpenSlide-rs需要OpenSlide。
您将找到一个Makefile来帮助您安装Ubuntu和MacOs所需的所有依赖项。以下是要运行以构建此crate的命令
依赖项
要构建此crate，您需要安装OpenSlide
您还将找到一个Makefile来帮助您安装Ubuntu和MacOs所需的所有依赖项
MacOs
brew update
brew install openslide
Ubuntu
apt-get update
apt-get install -y --no-install-recommends libopenslide-dev
更多信息
依赖项
~2.5–6MB
~111K SLoC