MSn Kit

一个用于处理质谱数据的库（Rust）和CLI（mm）。

• CLI快速入门
• 安装
• 用法
• 状态徽章

CLI快速入门

下载可执行文件后，使用 --help 查看命令和选项。

$ mm --help
msn-kit 0.2.3
Trent Hauck <[email protected]>
CLI for dealing with MGF files.

USAGE:
    mm [OPTIONS] <SUBCOMMAND>

FLAGS:
    -h, --help       Prints help information
    -V, --version    Prints version information

OPTIONS:
    -o <output-format>        The output file to write to [default: mgf]

SUBCOMMANDS:
    head               Similar to head(1) in that it can output the top n records from an MGF
                       file
    help               Prints this message or the help of the given subcommand(s)
    metadata-filter    Select spectra based on the key value pairs in the metadata
    stats              Compute stats for inputs

根据安装的版本与最后一次更新README的差异，您的界面可能不同 😄。您可能还希望将 mm 放置在您的 PATH 上的某个位置。

安装

版本发布在GitHub的发布页面上： https://github.com/tshauck/msn-kit/releases/latest。

从那里，下载适用于适当平台的版本。

目前有

• x86 Darwin
• x86 Linux
• x86 Windows
• ARM Linux

用法

关于CLI组织的一些建议。

• CLI以 mm 的单个入口点组织，然后是子命令，例如 mm stats、mm head、mm metadata-filter 等。它们都接受 -h 标志以获取帮助。
• 许多命令可以接受一个 -o 全局参数（即直接传递给 mm），以指定输出格式。 mgf 是一个选项，它会输出预期的内容。 json 也是一个选项，它将输出json记录，每行一个。

状态徽章

流程	状态
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