imzml

这个crate做什么？

• 读取质谱格式mzML或质谱成像格式imzML中的数据。
• 将数据文件与规范进行验证

读取mzML

let parser = MzMLReader::from_path("/path/to/data.mzML").unwrap();

for error in parser.errors() {
    println!("{:?}", error);
}

let mzml: MzML<_> = parser.into();

验证mzML

use imzml::validation::full_validate;

let mut validation_errors = full_validate(parser.ontology(), mzml);

读取imzML

let parser = ImzMLReader::from_path("/path/to/data.imzML").unwrap();

for error in parser.errors() {
    println!("{:?}", error);
}

let imzml: ImzML<_> = parser.into();

let mz_772 = imzml.ion_image(772.573, 100.0);

验证imzML

use imzml::validation::full_validate;

let mut validation_errors = full_validate(parser.ontology(), imzml);

lib.rs:

此库提供了一种访问存储在.mzML或.imzML数据格式中的质谱和质谱成像数据的手段。

let parser = ImzMLReader::from_path("/path/to/data.imzML").unwrap();

for error in parser.errors() { println!("{:?}", error); }

let imzml: ImzML<_> = parser.into();

imzml.ion_image(772.573, 100.0);