ChemCore

为 Rust 开发的化学信息学工具包。

ChemCore 提供了处理分子的基本工具。详细信息请参阅： ChemCore: A Cheminformatics Toolkit for Rust.

使用方法

将以下内容添加到您的 Cargo.toml

[dependencies]
chemcore = "0.4"

示例

解析环丙烷 SMILES，以深度优先顺序遍历，并查询其 Molecule 和 Graph 特性

use gamma::graph::{ Graph };
use gamma::traversal::{ DepthFirst, Step };
use chemcore::daylight::{ read_smiles, SmilesInputError };
use chemcore::molecule::{ Atom, Element, Molecule, Error };

fn main() -> Result<(), SmilesInputError> {
    let molecule = read_smiles(&"C1CC1", None)?;
    let traversal = DepthFirst::new(&molecule, 0).expect("traversal error");

    assert_eq!(traversal.collect::<Vec<_>>(), vec![
        Step::new(0, 2, false),
        Step::new(2, 1, false),
        Step::new(1, 0, true)
    ]);

    // Graph trait
    assert_eq!(molecule.degree(0), Ok(2));
    assert_eq!(molecule.size(), 3);
    assert_eq!(molecule.order(), 3);

    // Molecule trait
    assert_eq!(molecule.atom(0), Ok(&Atom {
        isotope: None,
        element: Some(Element::C),
        hydrogens: 2,
        electrons: 0,
        parity: None,
    }));
    assert_eq!(molecule.charge(0), Ok(0.));
    assert_eq!(molecule.bond_order(0, 1), Ok(1.));

    Ok(())
}

版本

ChemCore 尚未稳定。补丁版本永远不会引入破坏性更改，但次要/主要版本可能会的。

许可证

ChemCore 在 MIT 许可证下发布。有关详细信息，请参阅 LICENSE-MIT 和 COPYRIGHT。